传说中可以实现持有这一切愿望的宝物——圣杯，自久一来就成为了众多魔术师争相追求的目标。然而，为了得到圣杯，就需要奉献大量的魔力，于是便诞生了由7名被圣杯选出的魔术师，分别召唤出听命于他们的7名英灵使魔（好跟不同次元的人YY），进行惨烈的厮杀祭祀仪式，这个每隔一定时间就要爆发一次的战斗，被称为“圣杯战争”。 
 基本没有学习魔术的才能的魔术师卫宫士郎（后宫士郎），因为偶然的召唤出了真实身份不明的剑士Saber（咱伟大的女王大人啊啊啊啊啊！），而被卷入到了圣杯战争中。面对着接踵而来的各路强敌，即便无心参战，士郎也不的不以保命为首要前提，艰难的一路战斗下去。然而关于圣杯的真相却令人无比震惊，隐藏在“圣杯战争”背后的罪恶阴谋，其真正的目的是......